Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms