Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRBP1Q9P2E9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms