Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms