Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms