Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms