Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms