Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms