Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms