Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KIAA1549Q9HCM3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms