Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms