Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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