Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPR88Q9GZN0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms