Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms