Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK3Q9BYB0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms