Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms