Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB6Q9BUF5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms