Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
THUMPD2Q9BTF0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD2Q9BTF0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms