Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms