Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTA3Q9BTC8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms