Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms