Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDHD3Q9BSH5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDHD3Q9BSH5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDHD3Q9BSH5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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