Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms