Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SPOCK3Q9BQ16 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SPOCK3Q9BQ16 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SPOCK3Q9BQ16 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SPOCK3Q9BQ16 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SPOCK3Q9BQ16 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SPOCK3Q9BQ16 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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