Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNN2Q99439 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CNN2Q99439 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNN2Q99439 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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