Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB3IPQ96QF0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms