Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms