Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms