Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF4Q96M43 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms