Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms