Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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