Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms