Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BICD1Q96G01 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms