Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms