Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms