Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms