Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF18Q96CE8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms