Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms