Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms