Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms