Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC107Q8WV48 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC107Q8WV48 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC107Q8WV48 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC107Q8WV48 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC107Q8WV48 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms