Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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