Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms