Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms