Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMB4Q86W47 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms