Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms