Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUFY3Q7L099 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms