Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNDC1Q76NI1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms