Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms