Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL35Q6PF15 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms