Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q6P435 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q6P435 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms